Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tlr5Q9JLF7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms