Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM5

Yipf7, Protein YIPF7, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf7Q9JIM5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Yipf7Q9JIM5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Yipf7Q9JIM5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms