Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms