Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp29Q9ES63 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp29Q9ES63 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp29Q9ES63 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp29Q9ES63 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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