Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Clstn1Q9EPL2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms