Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl4Q9DCU6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl4Q9DCU6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms