Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rnft1Q9DCN7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rnft1Q9DCN7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rnft1Q9DCN7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnft1Q9DCN7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rnft1Q9DCN7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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