Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Tspan4Q9DCK3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tspan4Q9DCK3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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