Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syde1Q9DBZ9 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms