Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms