Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrpraQ9DBG7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms