Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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