Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc89Q9DA73 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms