Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gtf3c6Q9D8P7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gtf3c6Q9D8P7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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