Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms