Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx29Q9D3S3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms