Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms