Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms