Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trappc6bQ9D289 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trappc6bQ9D289 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trappc6bQ9D289 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trappc6bQ9D289 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trappc6bQ9D289 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trappc6bQ9D289 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trappc6bQ9D289 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Trappc6bQ9D289 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Trappc6bQ9D289 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Trappc6bQ9D289 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Trappc6bQ9D289 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms