Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Mrpl53Q9D1H8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms