Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Zbed3Q9D0L1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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