Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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