Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Sgo1Q9CXH7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Sgo1Q9CXH7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Sgo1Q9CXH7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Sgo1Q9CXH7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Sgo1Q9CXH7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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