Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Utp23Q9CX11 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms