Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms