Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUX1

Thap12, 52 kDa repressor of the inhibitor of the protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thap12Q9CUX1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thap12Q9CUX1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Thap12Q9CUX1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Thap12Q9CUX1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thap12Q9CUX1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Thap12Q9CUX1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thap12Q9CUX1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thap12Q9CUX1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thap12Q9CUX1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms