Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Fcf1Q9CTH6 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Fcf1Q9CTH6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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