Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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