Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ykt6Q9CQW1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms