Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms