Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q9CQM1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CQM1 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms