Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms