Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Znhit3Q9CQK1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms