Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms