Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms