Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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