Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV3

Mrpl42, 39S ribosomal protein L42, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl42Q9CPV3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl42Q9CPV3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl42Q9CPV3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms