Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramel1Q99MW3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramel1Q99MW3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms