Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrrtQ99MR6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrrtQ99MR6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrrtQ99MR6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrrtQ99MR6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrrtQ99MR6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrrtQ99MR6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrrtQ99MR6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrrtQ99MR6 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrrtQ99MR6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrrtQ99MR6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrrtQ99MR6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrrtQ99MR6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrrtQ99MR6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SrrtQ99MR6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrrtQ99MR6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms