Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms