Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Vmp1Q99KU0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Vmp1Q99KU0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Vmp1Q99KU0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Vmp1Q99KU0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Vmp1Q99KU0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Vmp1Q99KU0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Vmp1Q99KU0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Vmp1Q99KU0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Vmp1Q99KU0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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Vmp1Q99KU0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Vmp1Q99KU0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Vmp1Q99KU0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Vmp1Q99KU0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Vmp1Q99KU0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmp1Q99KU0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Vmp1Q99KU0 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Vmp1Q99KU0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Vmp1Q99KU0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms