Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms