Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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