Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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CsprsQ99388 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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CsprsQ99388 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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CsprsQ99388 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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CsprsQ99388 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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CsprsQ99388 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CsprsQ99388 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms