Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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