Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms