Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

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Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Smc1bQ920F6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smc1bQ920F6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smc1bQ920F6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smc1bQ920F6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smc1bQ920F6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smc1bQ920F6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smc1bQ920F6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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