Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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