Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r200Q8R281 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms