Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Fcho1Q8K285 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Fcho1Q8K285 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Fcho1Q8K285 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Fcho1Q8K285 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Fcho1Q8K285 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Fcho1Q8K285 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Fcho1Q8K285 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Fcho1Q8K285 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcho1Q8K285 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcho1Q8K285 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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